西云观始建于清雍正八年（1730年）。相传很久以前，王母曾居敦煌三危山，乘青鸟往来于瑶池之间，因而东来紫气，西呈祥云，登古城而晚眺，见霞光辉于垣西。当地群众遂集资修观于斯，命名为西云观（又名栖云观）。
西云观与三危山的王母楼、老君堂遥相对峙，和月牙泉古庙群鼎足而立。创建之初，有歇山顶式面阔三间的前、中殿各一座。后经两次续建，该观内有殿宇七座，错落有致，壮丽雄伟；南北斗楼耸立，高峻挺拔，前后垂柳花亭，别有情趣。观内的《西游记》故事彩色悬塑、鲁班窗和花鸟屏风画在当地号称三绝。