博物馆建于1991年7月1日，现有鲸类、鱼类、贝类、海藻类、虾蟹类、棘皮动物、腔肠动物以及其它水生动物等9间陈列室，共陈列水生生物标本近3000千种。这些标本按分类系统陈列，整齐美观，既有科学性和学术性， 以富知识性和趣味性，具有较高的教学、科研和观赏价值，也是进行科普教育的轩地。